艾克斯-馬賽大學的歷史可追溯至1409年由普羅旺斯伯爵路易二世建立的艾克斯大學。1968年"五月革命"后，法國公立大學體系改革，后分別發展成為以文學、藝術和人文科學為主的普羅旺斯大學(艾克斯-馬賽第一大學)、以技術醫學、理工為主的地中海大學(艾克斯-馬賽第二大學)和以經濟管理、法律為核心的保羅-塞尚大學(艾克斯-馬賽第三大學)。

三所大學自2007年起尋求合并，最終于2012年1月1日起協議生效，成立新的艾克斯-馬賽大學。

馬賽大學有五個主要校區，現在是法國規模最大的大學，也是法語國家和地區最大的大學。三校合并后，艾克斯-馬賽大學成為薩科齊政府領導下建設"超級大學"計劃中的一員，每年獲得法國政府7.5億歐元的撥款，是法國公立大學體系里獲得教育經費最多的大學。馬賽大學擁有數百個研究和教學合作伙伴關系，包括法國高等社會科學研究學院(EHESS)和國家科學研究中心(CNRS)。馬賽大學是歐洲大學協會(EUA)和地中海大學聯盟(UNIMED)成員。

本科/碩士/博士：法學、工學、管理學、教育學、經濟學、理學、歷史學、文學、醫學、哲學、藝術學

MBA：管理學

馬賽大學在藝術、文學、科學，法律，政治，商業，經濟等領域已經產生了許多出名的校友。迄今為止，教職員工中出現了5位諾貝爾獎獲得者，2位獲得普利策獎的獲獎者，4名塞薩爾獎獲得者，數位國家元首或政府首腦，議會議長，政府部長，大使和法蘭西學院院士。